O comando varia para cada versão que você tenha instalado, observe que no caso do Ubuntu temos 3 opções diferentes na loja do Windows, então o comando deve ser o correto ou não funcionará.

O comando deve ser executado em uma janela do CMD ou do PowerShell, de preferência como administrador e antes de ter aberto o bash do Linux desde a ultima vez que reiniciou o computador.

(Ubuntu)
ubuntu config --default-user root

(Ubuntu 18.04 LTS)
ubuntu1804 config --default-user root

(Ubuntu 16.04 LTS)
ubuntu1604 config --default-user root

(openSUSE Leap 42)
openSUSE-42 config --default-user root

(SUSE Linux)
SLES-12 config --default-user root

(Debian)
debian config --default-user root

(Kali Linux)
kali config --default-user root